هیأت رئيسه دانشگاه مركب است از رئيس و معاونان دانشگاه، معاونان به تناسب حجم كار و گستردگي دانشگاه تعيين مي شوند و تعداد آن ها حداكثر 7 نفر خواهد بود، بعضي از معاونت ها را مي­توان در هم ادغام كرد. اهم وظايف واختيارات هيأت رئيسه دانشگاه:

• فراهم كردن زمینه هاي اجرايي مصوبات شوراي عالي انقلاب فرهنگي و آيين نامه ها و بخشنامه هاي صادرشده ازسوي وزارت؛
• پيشنهاد نمودار تشكيلاتي و اصلاحات اداری لازم براي اداره امور داخلي دانشگاه به هيأت امناء از طريق رئيس دانشگاه؛
• بررسي و ارزيابي نحوه اجراي تصميمات هيأت رئيسه و نظارت برعملكرد واحدهاي دانشگاه؛
• فراهم كردن زمينه مردمی كردن دانشگاه و كمك به خودكفايی دانشگاه و واحدهاي وابسته؛
• ايجاد هماهنگی لازم بين حوزه های مختلف معاونت ها؛
• بررسي آيين نامه هاي اداري ومالي و معاملاتي دانشگاه براي طرح در هيأت امناء و تهيه پيشنهادها، طرح ها و برنامه هايي كه بايد در دستوركار هيأت امناء قرارگيرد؛
• پيشنهاد بودجه سالانه دانشگاه به هيات امناء از طريق رئيس دانشگاه؛